总工资是900元。便利店损失2498元，从我的工资中

不合理，单位无权随意扣发工资。《劳动法》规定，工资应按时足额支付，单位扣发工资需有合法依据。便利店未经同意扣工资，违反法律规定。若不及时处理，可能影响你的合法权益，造成经济损失。
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常见处理方式为协商或仲裁。应先与便利店协商，说明情况要求合理处理。若协商无果，可向当地劳动仲裁院申请仲裁，通过法律途径维护自身权益。
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不合理，可维权。具体操作：1.与便利店负责人沟通，明确表达不满，要求解释扣款原因并提供依据；2.若沟通无果，收集工作记录、工资条等证据；3.向当地劳动仲裁院提交仲裁申请，附上证据材料；4.等待仲裁结果，若不服可进一步提起诉讼。